1998年，台灣地區爆發腸病毒大流行，造成全台恐慌，腸病毒的嚴重性也開始被重視，幸好靠著臨床醫師們的警覺加上衛生單位的努力，雖然無法遏止腸病毒在全台肆虐，但卻將傷害減至最低。由於腸病毒的傳染途徑難以預防，加上病毒型別的特殊性、又常侵襲五歲以下幼童，因此疾病管制局結合相關衛生單位，強化疾病監測能力、感染個案醫療照護及提昇醫療檢診服務品質，提供民眾正確訊息，以減少受感染的機會，期能將腸病毒 對國人生理康及心理安寧所造成的危害與衝擊減至最低。
腸病毒的症狀及傳染途徑
腸病毒是一群病毒的總稱，包括23型A群克沙奇病毒、6型B群克沙奇病毒、3型小兒麻痺病毒、30型依科病毒及最後發現的68至71型腸病毒，一共有六十幾種病毒。
此種病毒世界各地都有，通常在夏季、初秋流行，台灣地區因位在亞熱帶，所以全年都可能有感染病例出現，但仍以夏季為主要流行季節。
腸病毒是經由接觸、飛沫或吃進被含有病毒之糞便所污染的食物而傳染，玩具常成為幼兒間傳染的媒介，尤其是帶毛的玩具，由於清洗不易，更容易帶有大量病毒而傳染給其他幼兒。傳染力始於發病的前幾天，在喉嚨與糞便都有病毒存在，而其腸道的病毒排出時間可以持續數週之久。一般而言，在發病後的一週內傳染力最高。它們在家庭中有很高的傳染率，在人群密集的地方，也較容易發生傳染。
感染病毒後大約二至十天以後才會出現症狀，但是大多數感染者，沒有臨床症狀或臨床症狀極為輕微，而大部分病例過了幾天之後就會自然痊癒。典型症狀為口腔、手掌、腳掌出現水泡、潰瘍，可能合併發燒。病程為七至十天。極少數個案，特別可能發生無菌性腦膜炎、腦炎、心肌炎、心包膜炎、麻痺等併發症。
在台灣，較常見且致死率最高的是腸病毒71型，根據李秉穎醫師的診斷經驗來說，五歲以下的幼童若感染腸病毒，會有較嚴重的併發症，大約有1000~10000分之一的致死率，由於人體免疫力的基因非常複雜，所以無法確實了解為何五歲以下的幼童有較高的致死率；另外，病例也有地區性集中的情況，所以居住環境應該也是腸病毒致病的重要因素之一。
台灣1998年第一次發生腸病毒71型大流行，由於其他國家如保加利亞、匈牙利也發生過類似的大流行，之後並沒有再度流行的狀況發生，但在台灣，2000年與今年，都還有幾十名的死亡病例發生，但也無法因此而推斷台灣從此每年都會有腸病毒71型的流行，因為腸病毒的種類有六十幾種，每次引發流行的腸病毒可能病毒類型都不一樣，但可以確定的是腸病毒71型，大部份都會有手足口病，手腳會有疹子，若病患為五歲以下幼童，應該要提高醒覺，特別是出現不尋常的嗜睡、肌躍型抽搐(類似受到驚嚇的突發性全身肌肉收縮動作)與持續嘔吐等，都必須馬上就醫。
一般來說，腸病毒發病後七天內是重症發生的危險期，家長應該要特別注意，醫師建議家長應該讓得到手足口病的小朋友多喝水多休息，因為小朋友常因口腔的水泡及潰瘍疼痛導致不願意吃東西及喝水，久了會造成脫水的現象，而幾個月大的嬰兒，更是有可能因長期的脫水而造成休克的情況；而多休息是指儘量不要運動，老一輩的人總認為感冒了要多運動多流汗才會好得快，但醫師說這是錯誤的概念，過去有動物實驗證明，感染了腸病毒後再劇烈運動，不但不會痊癒反而會提高重症的發生率，根據推測，應該是運動促進腸病毒擴散而容易造成併發症的發生，因此，讓小朋友多喝水多休息，是家長在照護時特別要注意的。
如何避免腸病毒感染
目前腸病毒中，除了小兒麻痺病毒以外，沒有疫苗可以預防，所以勤於正確洗手、保持良好個人衛生習慣，減少被傳染的機會是預防腸病毒的基本方法。
1. 時時注意個人衛生，經常正確洗手。正確的洗手方法如下：
A. 在水龍頭下把手淋濕
B. 擦上肥皂或洗手液
C. 兩手心互相磨擦
D. 兩手揉搓自手背至手指
E. 兩手揉搓手掌及手背
F. 作拉手姿勢以擦洗指尖
G. 用清水將雙手洗淨，關水前先捧水將水龍頭沖洗乾淨
H. 用乾淨的紙巾或烘手機將手烘乾
2. 流行期間儘量避免出入公共場所，不要跟疑似病患（家人或同學）接觸。
3. 注意環境衛生及通風。
4. 罹病之學童，宜請假暫勿上課，接受治療並好好休息，同時也可避免傳染其他學童。
5. 增強個人之免疫力，請注意營養、均衡飲食及運動。